A Diretoria é o órgão da administração executiva da FUNDUNESP, cabendo-lhe cumprir a legislação pertinente, o Estatuto, o Regimento Interno e as deliberações do Conselho Curador. Os Diretores serão nomeados pelo Reitor da UNESP, dentre seus docentes em Regime de Dedicação Integral à Docência e à Pesquisa - RDIDP, portadores, no mínimo, do título de Doutor. O mandato dos Diretores será de 04 (quatro) anos permitindo-se uma recondução. Mandatos estes coincidentes com o do Magnífico Reitor.

DIRETOR PRESIDENTE
Prof. Dr. Edson Luiz Furtado
DIRETOR VICE-PRESIDENTE
Profa. Dra. Vanderlan da Silva Bolzani

SECRETÁRIA
Nair Karayannopoulos (11) 3474-5346